苏州国家高新区近年以提升区域创新能力为目标，加快健全完善以企业为主体、市场为导向、人才为根本、官产学研金相结合的开放式区域科技开发和技术创新体系。坚持自主创新与引进创新相结合，一手抓国内外先进技术企业、研发机构和工程中心引进，一手抓拥有自主知识产权的民营科技企业培育。实施了包括国家及省火炬项目、重大攻关项目和重点推广项目在内的电子信息、生物工程、环保及新材料等高科技研发项目600多项，已经转化和实现产业化的450项。
苏州国家高新区着力营造局部优化的科技创新创业环境，兴建了大批创新平台，大大强化了区域自主创新特色和优势。除突出抓好部省市共建的苏州科技城和与中科院合作的苏南工业技术研究院等规模化创新载体外，苏州高新区先后建立了苏州高新技术创业服务中心、国际企业孵化器、留学人员创业园、环保产业园、苏高新创业园、软件园、新药创制中心、孵化企业发展基地、民营科技园等一批高水平的创新平台及产业化基地。
与此同时，苏州国家高新区还着力建设了一批高水准的公共技术研发平台，建立了华东地区首家国家级生物医药孵化器实验平台、国内首家IT人才实训基地、中科院物理所苏州技术研究院、国家软件与集成电路公共服务平台江苏分中心、苏南工业技术研究院等。为了建设孕育自主创新能力的特色产业化基地，形成规模化、特色化、国际化的创新集群，苏州国家高新区还大力推进特色园区建设，重点建设了苏州软件产业示范园、微系统园、国际生物医药产业园以及新材料、新能源技术应用基地等。
“十一五”期间，苏州国家高新区将以提高区域自主创新能力为主线，通过政府政策的支持，以及创新载体、融资体系、服务体系的建设，促进人才创业、项目开发和高科技产业化基地建设的同步发展。经过5年的努力，把苏州高新区建设成为区域自主创新的示范区、国家高新区自主创新的“排头兵”和区域最具创新活力的增长极。
